Второй сезон «Четырёх морских китов» начинается ровно с того момента, где закончился первый: гигантский кит, выброшенный на берег, начинает издавать низкочастотный гул, который слышат все четверо главных героев. Этот зов не просто звук — он запускает цепь событий, вскрывающих правду о происхождении китов. Оказывается, они не просто редкие животные, а ключевые элементы древнего механизма, управляющего течениями и климатом всего океана. Герои, разлучённые после первой встречи, вынуждены снова объединиться, но теперь каждый из них преследует личную цель. Один ищет способ вернуть утраченную память, другой — спасти свой остров от наступающего холода, третий пытается понять, почему его собственное тело начинает реагировать на зов китов, а четвёртый просто хочет защитить тех, кого полюбил. Их пути пересекаются в портовом городе, где местные рыбаки поклоняются китам как богам, а учёные из континентального института пытаются изучить феномен, не понимая его сути.
По мере продвижения на юг, к месту, где, по легендам, спит самый первый кит, герои сталкиваются с последствиями дисбаланса: моря мелеют, рыба уходит, а на горизонте появляются чёрные смерчи, разрывающие небо. В этом сезоне раскрывается, что киты — не просто существа, а живые резервуары энергии, и их гибель запускает цепную реакцию. Один из героев, пытаясь спасти раненого детёныша, случайно активирует древний артефакт, который связывает его сознание с коллективным разумом китов. Он видит прошлое: как люди когда-то заключили сделку с этими гигантами, получив спокойные воды и обильный улов в обмен на то, что будут хранить тайну их существования. Но сделка была нарушена, и теперь киты уходят, унося с собой тепло. Финальные серии подводят к выбору: либо позволить китам уйти и навсегда изменить мир, либо попытаться восстановить древний договор ценой собственной свободы. Последний кадр сезона — одинокий герой стоит на носу лодки, а из-под воды поднимается огромный глаз, смотрящий прямо на него.