Третий сезон «Музыкальной школы звёзд» начинается с того, что Академия Сейка получает приглашение на престижный международный фестиваль «Гранд-Гармония». Однако директор ставит жёсткое условие: участвовать может только один коллектив, и он должен быть сформирован из студентов, которые никогда раньше не выступали вместе. Это решение раскалывает школу на два лагеря. Старшеклассники, уже имеющие опыт побед, считают, что новички не справятся, а первокурсники видят в этом шанс доказать свою состоятельность. Главная героиня, Мидори, оказывается в центре конфликта: её лучшая подруга Рин входит в экспериментальную группу, а бывший наставник Мидори, талантливый пианист Кэнта, становится скептиком и отказывается помогать новому составу. Чтобы примирить стороны, Мидори решает создать секретный проект — смешанный ансамбль, где каждый участник представляет разные музыкальные направления: от классики до электронной музыки.
Параллельно раскрывается тайна старой музыкальной шкатулки, найденной в подвале академии. Она оказывается артефактом, принадлежавшим основательнице школы, которая мечтала объединить все жанры в единую симфонию. Мидори и её друзья понимают, что их проект — не просто выступление, а восстановление утраченного наследия. Но на пути встаёт не только внутреннее сопротивление, но и внешняя угроза: конкурирующая академия «Кристалл-Ноктюрн» использует грязные методы, чтобы дискредитировать Сейку. В финале сезона, во время отборочного тура, экспериментальный ансамбль исполняет сложнейшую композицию, где вокал, ударные и синтезатор сливаются с классической скрипкой. Зал взрывается овациями, но судьи замирают в нерешительности: такой музыки они ещё не слышали. Последняя сцена оставляет интригу — шкатулка начинает светиться, а на небе появляется созвездие, которое, по легенде, указывает путь к истинному таланту.
