Лето. Школьница Рюко, которую исключили из клуба по волейболу, приходит в аквариум, где работает её мать. Она чувствует себя потерянной, не вписывающейся ни в компанию сверстниц, ни в собственную жизнь. В огромном зале с главным аквариумом она замечает двух мальчиков, плавающих среди скатов и тунца. Их зовут Уми и Сора, и они, кажется, чувствуют себя в воде более естественно, чем на суше. Выясняется, что братья были выращены дюгонями в открытом океане и обладают необъяснимой связью с морскими существами. Директор аквариума, старый друг их отца, просит Рюко присматривать за мальчиками, пока учёные пытаются разгадать тайну их происхождения. Сначала Рюко раздражает их отстранённость и странное поведение — они могут часами неподвижно лежать на воде или внезапно исчезать. Но постепенно, наблюдая за тем, как Уми и Сора реагируют на фазу луны и поведение рыб, она начинает замечать, что мир вокруг неё полон скрытых ритмов и звуков, которые она раньше игнорировала.
Однажды в аквариум привозят загадочное яйцо, найденное в море. Оно пульсирует, меняет цвет и, кажется, притягивает к себе Уми и Сору. Вместе с Рюко они отправляются на ночное побережье, где происходит нечто необъяснимое: небо и вода начинают светиться, а метеоритный дождь отражается в океане. Рюко чувствует, что мальчики — не просто люди, а часть древнего цикла, связанного с рождением галактик. События начинают выходить из-под контроля: вода в аквариумах мутнеет, рыбы мечутся, а само яйцо начинает расти. Уми и Сора, ведомые инстинктом, уходят в открытое море, и Рюко бросается за ними. В финале, когда яйцо раскрывается, выпуская поток света, который грозит поглотить всё вокруг, Рюко понимает, что её задача — не спасать мальчиков, а стать свидетелем и связующим звеном между человеческим миром и бесконечной, пугающей и прекрасной стихией, которая не подчиняется логике. Она принимает этот опыт, переставая бояться неизвестности, и находит покой в осознании, что она — лишь крошечная часть огромного, дышащего космоса.
