Второй сезон «Звучи, эуфониум!» начинается с того, что старшая школа Китаудзи готовится к национальному конкурсу. После победы на фестивале в Кансае настроение в оркестре приподнятое, но напряжение только нарастает. Кумико Одзумаки, играющая на эуфониуме, всё больше осознаёт, как сильно изменилась её жизнь с приходом в духовой оркестр. Она наблюдает за старшими — Рэйной Косака, чья игра на трубе становится всё более уверенной, и Асукой Танакой, чья загадочность и отстранённость начинают тревожить не только Кумико, но и весь коллектив. Асука, лучшая эуфонистка школы, вдруг заявляет, что может уйти из оркестра из-за давления со стороны семьи. Её отец, не одобряющий увлечение дочери музыкой, настаивает на том, чтобы она сосредоточилась на учёбе. Это ставит под угрозу не только выступление на национальном уровне, но и моральный дух всего ансамбля. Кумико, чувствуя личную связь с Асукой, пытается понять её мотивы и помочь, но сталкивается с глухой стеной — Асука не привыкла открываться другим.
Параллельно развивается линия с Сапфирой Кавасимой и Хадзуки Като, которые пытаются найти свой собственный голос в оркестре, не теряясь на фоне талантливых солистов. Нодзоми Касаки, бывшая участница оркестра, возвращается в школу, чтобы помочь с подготовкой, но её появление вскрывает старые раны — особенно в отношениях с Мидзуно Юрико, с которой у них когда-то был конфликт. Конкурсные репетиции становятся испытанием для всех: дирижёр Таки Нобору требует идеального звучания, но внутренние распри и личные драмы мешают оркестру стать единым целым. Кумико, пытаясь разобраться в себе, всё чаще вспоминает свою среднюю школу и подругу, с которой они вместе начинали играть. В финале сезона, когда оркестр наконец выходит на сцену национального конкурса, каждый участник должен сделать выбор — играть ради победы или ради того, чтобы их голос был услышан. Кульминацией становится исполнение пьесы, где эуфониум Кумико и Асуки сливаются в едином дыхании, доказывая, что музыка способна преодолеть любые преграды, даже если после конкурса пути участников разойдутся.
